Το μικροβιολογικό τμήμα επεξεργάζεται βιολογικά δείγματα με στόχο την ανίχνευση των παθογόνων μικροοργανισμών, την ταυτοποίηση τους και τη διεξαγωγή του σωστού αντιβιογράμματος για την εμπεριστατωμένη αντιμετώπιση της νόσου.
Tο τμήμα είναι πλήρως εξοπλισμένο με όλα τα απαραίτητα υλικά  για την ορθή, αξιόπιστη και άμεση επεξεργασία των δειγμάτων. Οι αναλύσεις εκτελούνται βάση σύγχρονων πρωτοκόλλων, ακολουθούν διεθνείς οδηγίες επεξεργασίας δειγμάτων και ανάλυσης των αποτελεσμάτων, ενώ ελέγχονται εσωτερικά και εξωτερικά με τεχνικές ποιοτικού ελέγχου.

Στο εργαστήριο εκτελούνται:

• Άμεσες μικροβιολογικές εξετάσεις – χρώσεις και καλλιέργειες όλων των βιολογικών δειγμάτων
  
  (Ούρα, κόπρανα, σπέρμα, κολπικό έκκριμα, υγρό τραύματος και δερματικών βλαβών, οφθαλμικό έκκριμα, πτύελα και βρογχικές εκκρίσεις, φαρυγγικό επίχρισμα, ουρηθρικό και προστατικό έκκριμα, αρθρικό υγρό)
  
• Μέθοδοι ελέγχου ευαισθησίας στα αντιβιοτικά – κλασικό αντιβιόγραμμα-  M.I.C. test
  
  (Minimum Inhibitory Concentration) , δοκιμασία ελάχιστης συγκέντρωσης αναστολής αλλά και συνδυαστικές δοκιμασίες με δισκία αντιβιοτικών ή με ταινίες για την ανίχνευση μηχανισμών αντοχής των μικροβίων.
  
  – Έλεγχος Ampc
  
  – Έλεγχος ESBL
  
  – Αντιμυκητόγραμμα και αντιβιόγραμμα για μυκόπλασμα -ουρεόπλασμα.
  
  Ακολουθούνται οι τελευταίες οδηγίες και κατευθυντήριες γραμμές της Ευρωπαϊκής Εταιρείας
  ελέγχου ορίων μικροβιακής αντοχής.
  
• Ανοσοχρωματογραφία για ανίχνευση αντιγόνων
  
  Ανίχνευση αντιγόνου Helicobacter Pylori, αδενοιού, ροταιού, χλαμυδίων, κρυπτoσποριδίου
  
  Ανίχνευση αναπνευστικών ιών  Sars Cov 2, Γρίπη Α/Β
  
  Ανίχνευση  β αιμολυτικού στρεπτοκόκκου Α (strep test), β αιμολυτικού στρεπτόκοκκου Β
  
  Ανίχνευση αντιγόνου και τοξίνης C.difficile
  
• Ορολογικές εξετάσεις
  
  για  τον έλεγχο βακτηριακών, ιογενών και παρασιτικών λοιμώξεων καθώς και βιοδεικτών
  
  (Mono test, RPR,  Widal,  Wright, Ra test)